东方天意-专注于生信分析

生信探索 生信分析笔记 2023-06-12 16:19 发表于陕西A SnakeMake workflow for Bulk RNA-seqReads were mapped onto ensembl genome with STAR, and adapters were removed with fastp.For nomalisztion, gtftools was used to c...

原创 Bioinformatics： 生信分析笔记 2023-06-05 22:31 发表于陕西R语言多线程加速通常情况下，R语言只能使用一个线程来进行计算，因此计算的速度及其感人！最近刚好有一个需求：我有一个参考数据表，里面存放了30万条基因的名称和位置信息，现在我想从里面找到指定的6000个基因的位置信息。最简单的方法是用两层for循环进行迭代，一分钟写出以下代码：for (i in 1...

原创 Bioinformatics： 生信分析笔记 2023-06-02 08:02 发表于陕西Linux版 百度网盘本文主要目的是在Linux环境下通过命令行来使用百度云盘！直接在服务器上将数据（比如基因组等大文件）传输到百度网盘，之后可以进行轻松分享，而且还可以支持备份，解决文件的传输和分享难题。软件简介bypy是一个Python客户端，用于操作百度网盘，提供了丰富的命令行操作。该工具能...

原创 Bioinformatics： 生信分析笔记 2023-05-29 11:52 发表于陕西浮点数间慎用比较在R语言中，输入一个简单的计算题：0.3-0.7+0.4，得到的结果是5.551115e-17，而随机叫一个小学二年级的同学来口算，这个题答案等于0，但是R语言不这么认为！> 0.3-0.7+0.4[1] 5.551115e-17> 0.3-0.7+0.4 == 0[1] FALS...